1994 — Создано Акционерное общество «Казахстано-Российский университет». Приоритетная задача — сохранение единого образовательного пространства с российскими вузами.

1995 — Казахстано-Российский университет реорганизован в Институт экономики и инжиниринга. Впервые в стране в частном вузе открыта подготовка по инженерным специальностям.

1997 — Институт экономики и инжиниринга преобразован в Павлодарский университет (ПаУ) в состав которого вошли: школа-лицей, колледж, ИПК, НИИ, центр маркетинга и набора, консалтинговая фирма, центр развития государственного языка.

2002 — Колледж ПаУ выделен в самостоятельное юридическое лицо. Введено в эксплуатацию современное общежитие на 150 мест. Открыл двери введенный в эксплуатацию главный корпус ВУЗа.

2006 — ПаУ переименован в Инновационный Евразийский университет. В едином университетском комплексе объединены Инженерная академия, Академия образования, Академия управления, Академия здоровья и Академия культуры.

2014 — ИнЕУ осуществляет подготовку специалистов по 55 специальностям бакалавриата, 23 специальностям магистратуры. Реализованы программы двудипломного образования с зарубежными ВУЗами. Совместно с АО «НАТР» открыт региональный офис коммерциализации технологий. Реализуются казахстанские и международные гранты на проведение исследований.

2016 — В ИнЕУ уже 53 специальности бакалавриата, 24 магистратуры, включая новую — ЮРИСПРУДЕНЦИЯ, и две специальности докторантуры. Также ведется подготовка магистров делового администрирования (MBA). Все магистранты проходят обязательную международную стажировку. Для студентов изучающих китайский язык доступно бесплатное обучение в Китае. Если в прошлом учебном году программами академической мобильности воспользовались 142 преподавателя и студента, в этом году уже 178 человек. Помимо этого, мы гордимся победой в международных проектах Британского Совета, Ньютон-альфараби и Европейского Союза ERASMUS +. В этом году ИнЕУ единственный среди частных вузов Казахстана вошел в топ 200 и получил знак превосходства две звезды в рейтинге вузов QS World University Rankings.

2017 — Инновационный Евразийский университет получил престижное звание «Лидер года-2017» по результатам комплексного независимого анализа Национального бизнес-рейтинга. По решению Аккредитационного совета Независимого агентства аккредитации и рейтинга (НААР) 11 образовательных программ в трех кластерах Инновационного Евразийского университета успешно аккредитованы.

2018 — Инновационный Евразийский университет (ИнЕУ) стал единственным частным университетом Казахстана, вошедшим в рейтинг QS вузов Центральной Европы и Центральной Азии. Независимым агентством аккредитации и рейтинга (НААР) определены лучшие вузы Казахстана. ИнЕУ — единственный вуз из Павлодара в двадцатке лучших! В Генеральный рейтинг РК — 2018 вошли 58 вузов, из которых 6 национальных, 21 государственных, 7 акционерных и 24 частных организаций образования.

2019 — Согласно данным Независимого агентства по обеспечению качества в образовании (IQAA) был составлен Национальный (генеральный) рейтинг-2019 лучших вузов Казахстана, сформированный на основе анализа академических статистических показателей, оценки экспертов и опроса работодателей. ИнЕУ занял в рейтинге 12 место.
ИнЕУ выиграл грант Комитета науки Министерства образования и науки РК по линии Всемирного Банка развития для обучения сотрудников английскому языку в размере 105 миллионов тенге.
Комитет науки МОН РК в рамках реализации проекта «Стимулирование продуктивных инноваций» объявил о победителях конкурса по отбору офисов трансферта/коммерциализации технологий в университетах Республики Казахстан. Инновационный Евразийский университет в числе победителей.
2 профессора ИнЕУ — Шолпан Шапиевна Хамзина и Айнагуль Кенжешовна Оспанова победили в Республиканском конкурсе «Лучший преподаватель вуза» 2019 года.
ИнЕУ первыми внедрили сдачу экзаменов по методу анонимного «Слепого оценивания».
ИнЕУ выиграл грант посольства Казахстана в США для реализации программы академической мобильности и совместной разработки с американским университетом «Old Dominion» образовательных программ в сфере IT и бизнеса.